Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc50Q810U5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms