Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms