Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TnnQ80Z71 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TnnQ80Z71 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms