Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp8Q80YR6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms