Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y56

Rbsn, Rabenosyn-5, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbsnQ80Y56 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RbsnQ80Y56 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RbsnQ80Y56 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RbsnQ80Y56 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RbsnQ80Y56 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RbsnQ80Y56 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RbsnQ80Y56 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RbsnQ80Y56 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RbsnQ80Y56 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RbsnQ80Y56 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RbsnQ80Y56 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RbsnQ80Y56 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RbsnQ80Y56 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RbsnQ80Y56 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RbsnQ80Y56 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RbsnQ80Y56 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RbsnQ80Y56 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms