Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2bQ80XK6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg2bQ80XK6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms