Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms