Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms