Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ckap2lQ7TS74 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ckap2lQ7TS74 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms