Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrc2bQ7TPM1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms