Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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ScocQ78YZ6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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ScocQ78YZ6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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ScocQ78YZ6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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ScocQ78YZ6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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ScocQ78YZ6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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ScocQ78YZ6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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ScocQ78YZ6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScocQ78YZ6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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