Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms