Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3F0

P4ha3, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha3Q6W3F0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P4ha3Q6W3F0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms