Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms