Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms