Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dtx4Q6PDK8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dtx4Q6PDK8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Dtx4Q6PDK8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dtx4Q6PDK8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dtx4Q6PDK8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dtx4Q6PDK8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dtx4Q6PDK8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dtx4Q6PDK8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dtx4Q6PDK8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dtx4Q6PDK8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dtx4Q6PDK8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms