Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvoplQ6PDF3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms