Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms