Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc3bQ6PDC0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms