Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh1Q6IUP1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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