Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt77Q6IFZ6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt77Q6IFZ6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms