Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kiaa1549Q68FD9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kiaa1549Q68FD9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms