Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp4eQ66X19 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrp4eQ66X19 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms