Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf2Q64705 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms