Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PtprdQ64487 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms