Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf4Q64310 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms