Protein–RNA interactions for Protein: Q63739

Ptp4a1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a1Q63739 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptp4a1Q63739 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms