Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lcn3Q62471 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lcn3Q62471 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lcn3Q62471 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lcn3Q62471 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lcn3Q62471 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lcn3Q62471 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lcn3Q62471 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lcn3Q62471 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lcn3Q62471 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lcn3Q62471 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lcn3Q62471 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lcn3Q62471 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn3Q62471 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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