Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcncQ62447 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CcncQ62447 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms