Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vamp1Q62442 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Vamp1Q62442 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Vamp1Q62442 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Vamp1Q62442 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp1Q62442 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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