Protein–RNA interactions for Protein: Q62351

Tfrc, Transferrin receptor protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfrcQ62351 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TfrcQ62351 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TfrcQ62351 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfrcQ62351 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfrcQ62351 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfrcQ62351 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfrcQ62351 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfrcQ62351 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfrcQ62351 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfrcQ62351 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfrcQ62351 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfrcQ62351 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfrcQ62351 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfrcQ62351 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfrcQ62351 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfrcQ62351 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfrcQ62351 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TfrcQ62351 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TfrcQ62351 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms