Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms