Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Prm3Q62100 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Prm3Q62100 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Prm3Q62100 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Prm3Q62100 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Prm3Q62100 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Prm3Q62100 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prm3Q62100 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms