Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad21Q61550 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms