Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd53Q61451 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms