Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Acvr1bQ61271 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms