Protein–RNA interactions for Protein: Q61048

Wbp4, WW domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wbp4Q61048 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Wbp4Q61048 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wbp4Q61048 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms