Protein–RNA interactions for Protein: Q61001

Lama5, Laminin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 3,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama5Q61001 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lama5Q61001 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lama5Q61001 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lama5Q61001 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lama5Q61001 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lama5Q61001 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lama5Q61001 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lama5Q61001 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lama5Q61001 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lama5Q61001 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lama5Q61001 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms