Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf3Q60803 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms