Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2cQ60772 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms