Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mkrn3Q60764 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms