Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd5Q5VCS6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Tdrd5Q5VCS6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Tdrd5Q5VCS6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd5Q5VCS6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms