Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms