Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AbrQ5SSL4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms