Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TefmQ5SSK3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms