Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RilpQ5ND29 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RilpQ5ND29 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms