Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm12253Q5NC48 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm12253Q5NC48 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm12253Q5NC48 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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