Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clhc1Q5M6W3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms