Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnni3kQ5GIG6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms