Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Prkaa1Q5EG47 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prkaa1Q5EG47 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms